A / home / destina-se a documentos pessoais; não para instalação de software. Além disso, nem todos os computadores são apenas por um usuário e isso economiza muito espaço para todos nós.
Se você quiser um software instalado em / home /, você pode: instalar de source e você pode dizer durante a compilação que o diretório de instalação deve ser algo em / home /.
Se o seu sistema estiver cheio com 30 Gb, você deve considerar o motivo. Eu nunca ultrapasse 15Gb e isso é com apache e mysql e um banco de dados razoavelmente grande. Talvez exista algo que você nunca usa e que possa ser excluído.