Eu tive o mesmo problema por um tempo e corrigi-lo da seguinte forma:
Eu corro o comando sudo iotop
no terminal. A saída de seu comando mostrou que a maioria das E / S "misteriosas" estava sendo executada pelos processos updatedb / mlocate e updatedb / locate.
Pelo que entendi, a função desse processo iniciado pelo cron é manter um db linux interno atualizado, por meio do qual o sistema torna a localização dos arquivos muito mais eficiente.
Minha solução foi desativar a execução deste processo por meio dos comandos
sudo chmod -x /etc/cron.daily/mlocate
sudo chmod -x /etc/cron.daily/locate
No entanto, para evitar a degradação do banco de dados para a localização de arquivos, eu periodicamente executo o locate e o mlocate em um momento adequado. Os seguintes comandos tornam esses processos executáveis novamente:
sudo chmod +x /etc/cron.daily/mlocate
sudo chmod +x /etc/cron.daily/locate