Se a sua máquina não for uma das mais rápidas, eu diria que a própria janela do gráfico da CPU do monitor do sistema está consumindo o tempo da CPU.
Eu tenho o Intel Duo 2x2.0GHz e não consigo obter a carga exibida abaixo de talvez 50% se essa janela de gráfico estiver aberta.
Acesse as configurações e ajuste o atraso de atualização para 1 segundo ou mais. Isso deve fazer uma grande diferença, mas, pelo menos para mim, não salva essa configuração.
Ou verifique o uso da CPU com outras ferramentas como top
do terminal ou indicator-multiload
(geralmente tem que ser instalado primeiro), que exibe um pequeno gráfico no seu painel.