Instale o GParted e o gpart.
sudo apt-get install gparted gpart
Execute o GParted (você precisará digitar sua senha, pois ela requer privilégios de root para ser executada).
Selecione seu disco rígido externo.
Selecione Dispositivo então Tentativa de Recuperação de Dados
Isso tentará localizar os arquivos no disco e abrir um navegador de arquivos, a partir do qual você poderá copiá-los para outro disco rígido.