Quando você inicia uma atualização de versão, a ferramenta de atualização desativa todos os PPAs (comenta as linhas de origem desses arquivos). Você precisará habilitá-los manualmente após a atualização, editando os arquivos e removendo o comentário das linhas ou usando a ferramenta Software Sources. Em ambos os casos, você terá que alterar a entrada de precise
para trusty
. Então, se você quiser parar de usar a versão do PPA para algum PPA, não faça nada, apenas atualize. :)
Se os pacotes existentes tiverem um caminho de atualização, eles serão atualizados (assim, o nginx será atualizado para qualquer versão disponível para o 14.04), independentemente de onde eles vieram. Se os pacotes existentes não tiverem candidato de instalação na nova versão e não entrarem em conflito com mais nada, eles serão deixados como estão. Se você usar algo como o Synaptic ou o Aptitude, eles aparecerão como pacotes locais ou obsoletos.