Tente redefinir o Compiz, pois pode haver algum problema com ele. Muitas vezes ao tentar ambiente de desktop diferente também ocorre.
Para redefinir todas as configurações do Compiz (isso inclui todas as configurações de plugins, etc) para os valores padrão, abra um terminal (não executá-lo com ALT + F2! Geralmente, tudo está bem o painel superior e lançador desaparece após a execução o primeiro comando, mas vai aparecer depois do segundo, então use um terminal) e digite:
gconftool-2 --recursive-unset /apps/compiz-1
gconftool-2 --recursive-unset /apps/compizconfig-1
unity --reset
Você também pode tentar:
rm -rf ~/.config/compiz-1/compizconfig