1. Execute um comando, isso significa executar um comando e um nome de programa não é um comando na maioria das vezes.
2. Eu acho que isso pode ser um problema / característica gnome ou gtk. Eu posso usar atalhos ao usar o menu de contexto no Firefox e no LibreOffice.
3.Você pode selecionar o modo de exibição de coluna para mostrar detalhes de arquivos e nas preferências do Nautilus você pode definir quais detalhes mostrar. É verdade que o Nautilus foi retirado de muitas de suas características, mas você também pode tentar Nemo , um fork Nautilus que mantém muitos dos seus recursos.
4.Parece que você tem o login automático ativado, basta desativar o login automático e não deve ter problemas.