/ home DEVE ser montado em um sistema de arquivos que suporte permissões para que descarte qualquer coisa que a Microsoft tenha (ntfs, fat). Os diretórios em / home / $ USER / você pode colocar em um disco externo ou em outra partição e podem ser NTFS.
Eu optaria por uma partição separada formatada como NTFS e armazenaria seus documentos lá. Deixe / home vazio de arquivos privados e você pode manter isso em 25 Gb.