Se você fizer isso a partir do terminal, apt
lembrará o que já foi baixado, e deve apenas continuar de onde parou. É o mesmo com yum
no Fedora.
Para atualizar com o apt no terminal, faça:
sudo apt-get update
e:
sudo apt-get upgrade
para fazer um upgarde dist (ou seja, ubuntu 13.04 para 13.10) então faça:
sudo apt-get dist-upgrade
Para mais informações, consulte link e link