Seu sistema de arquivos está corrompido; faça backup dos seus dados imediatamente. Quando o seu sistema se torna como o da primeira tela; pressione F para corrigir a partição. Mas eu fazia backup dos meus dados primeiro antes de fazer isso.
Se persistir, você pode iniciar o Ubuntu a partir de um Live CD / USB e abrir um gerenciador de partição, clicar com o botão direito do mouse na partição do Ubuntu instalada e selecionar a opção de verificação.