Eu limpei seu eclipse.ini. É testado com o Eclipse 4.2 Juno. Por favor, informe se funciona com o seu plugin scala:
--startup plugins/org.eclipse.equinox.launcher_1.3.0.v20130327-1440.jar --launcher.library plugins/org.eclipse.equinox.launcher.gtk.linux.x86_64_1.1.200.v20130807-1835 -product org.eclipse.epp.package.jee.product --launcher.defaultAction openFile -showsplash org.eclipse.platform --launcher.XXMaxPermSize 256m --launcher.appendVmargs -vmargs -XX:PermSize=64m -XX:MaxPermSize=256m -Xms40m -Xmx512m -Xss1M -server -XX:+DoEscapeAnalysis -XX:+UseConcMarkSweepGC -XX:+UseCompressedOops -Dosgi.requiredJavaVersion=1.6
Para referência futura: Tenha cuidado ao adicionar opções ao eclipse.ini. Tome especial cuidado com o que acontece antes de -vmargs
e o que acontece depois.
Além disso, nenhuma opção deve ser definida duas vezes.