Você precisa escolher Diskimage ao invés de escolher uma distribuição, e procurar o arquivo que você baixou, e escolher isso para criar o USB. Veja a imagem abaixo.
Eu tenho o Ubuntu 13.04 desktop-i386 baixado, mas há várias opções no UNetbootin para a distribuição e não sei o que escolher.
Você precisa escolher Diskimage ao invés de escolher uma distribuição, e procurar o arquivo que você baixou, e escolher isso para criar o USB. Veja a imagem abaixo.