se você precisar fazer particionamento avançado, sugiro usar o gparted para lidar com isso e, em seguida, apenas usar a opção else else no instalador e dizer a ele o que usar para cada partição
menos que 2.9GB é muito pequeno para instalar o ubuntu em sua totalidade, é bom para uma parte dele, este vídeo aborda o particionamento avançado: link
Se você está tentando dualboot com o windows você precisa redimensionar as janelas para abrir espaço (defrag windows 1st, a menos que você esteja usando um ssd)