Sua instância do EC2 é apenas uma máquina como qualquer outra a esse respeito. Seu gerenciamento de pacotes atualiza as listas de pacotes dos repositórios regularmente por padrão no Ubuntu. Quando você efetua login no sistema, um script consulta o gerenciamento de pacotes sobre a quantidade de atualizações nos canais regular e de segurança e o exibe.
% bl0ck_qu0te% A Canonical publica os pacotes nos repositórios principais e também configura os espelhos aos quais sua máquina se conecta na instalação padrão. Veja o arquivo /etc/apt/sources.list e arquivos em /etc/apt/sources.list.d/ (se houver).
Em todo o mundo, muitos espelhos existem e a Amazon é apenas um deles.