O Nautilus é um gerenciador de arquivos, enquanto o Unity é um ambiente de área de trabalho que usa o Nautilus como gerenciador de arquivos padrão e exibe o plano de fundo da área de trabalho. Como são coisas bem diferentes, não há como substituir o Unity pelo Nautilus.
Se você não gosta do Unity, pode dar uma olhada em outros ambientes de desktop como o Unity 2D (instalado por padrão), o Gnome Classic (pacote de instalação gnome-session-fallback
) ou o desktop Xubuntu (pacote de instalação xubuntu-desktop
). Na tela de login, você pode escolher a área de trabalho que deseja usar.