Parece que isso não é possível no File Roller, mas como alternativa (como você pediu) você pode usar o xarchiver .
Parainstalá-lo,cliquenestebotão:
Elenãoabriráumanovajanela,masabriráumanovaguianajanelaexistente.Aquiestáumacapturadeteladoxarchiver:
Existe uma maneira ou uma opção no File Roller para usar uma única sessão de janela.
O padrão é abrir uma janela separada para cada arquivo que você abrir.
Isso é possível ou há gerenciadores de arquivos alternativos com esse recurso?