Eu sinto que você pode não ter o bloqueador de pop-ups ativado no Chrome. Agora, para ativá-lo, aqui está o que você faz.
Digite chrome://chrome/settings/content
na sua barra de endereços (no chrome) e role para baixo até encontrar Pop-ups e verificar a opção Do not allow any site to show pop-ups
.
Se o problema persistir, sugiro reinstalar o Chrome.
Espero que isso tenha sido de alguma ajuda.