Não muito, o PinguyOS é baseado no Ubuntu, funciona principalmente com pacotes do Ubuntu e deve ser quase idêntico ao Ubuntu. Mas não é desenvolvido ou suportado pelo Ubuntu.
As principais diferenças entre o PinguyOS e o Ubuntu são
- O PinguyOS usa um ambiente de trabalho pesado do GNOME3
- Instala por padrão codecs que não são incluídos pelo Ubuntu devido às suas licenças
- Ele contém por padrão muitos softwares que não estão instalados no Ubuntu por padrão, explicando o download mínimo de DVD de 1.6Gb necessário para instalá-lo
No final, além de licenças e pacotes pessoais, alguns ajustes visuais e scripts, não é diferente do Ubuntu.
Mas como o Ask Ubuntu lida apenas com os sabores oficiais do Ubuntu ou do Ubuntu, o PinguyOS está fora do assunto para a maioria das questões aqui.