Se você se sentir confortável com o terminal, poderá alterar os locais padrão dos documentos e diretórios de mídia a qualquer momento após a instalação com o comando xdg-user-dirs-update . Supondo que seu HDD esteja montado como /mnt/bigdrive :
xdg-user-dirs-update --force --set DESKTOP /mnt/bigdrive/Desktop
xdg-user-dirs-update --force --set DOWNLOAD /mnt/bigdrive/Downloads
xdg-user-dirs-update --force --set TEMPLATES /mnt/bigdrive/Templates
xdg-user-dirs-update --force --set PUBLICSHARE /mnt/bigdrive/Public
xdg-user-dirs-update --force --set DOCUMENTS /mnt/bigdrive/Documents
xdg-user-dirs-update --force --set MUSIC /mnt/bigdrive/Music
xdg-user-dirs-update --force --set PICTURES /mnt/bigdrive/Pictures
xdg-user-dirs-update --force --set VIDEOS /mnt/bigdrive/Videos
O parâmetro --force criará os novos diretórios se você ainda não os criou manualmente.
Se você já tiver conteúdo nesses diretórios, precisará movê-los manualmente e provavelmente desejará excluir os diretórios originais em seu diretório pessoal (ou substituí-los por links para os novos diretórios) para limpar a desordem e evite confusão.
Eu gosto de deixar o DESKTOP no SSD (neste caso, deixar de fora o comando --set DESKTOP acima) e manter a mídia com a qual estou trabalhando ativamente, para que você possa aproveitar a velocidade do SSD, por ex. editando um vídeo.
Você também pode atribuir toda a árvore de diretórios / home ao seu HDD durante a instalação, mas depois isso vai atrasá-lo um pouco enquanto executa operações comuns de leitura / gravação de / para qualquer lugar nos diretórios base, como $HOME/.config/ .