Eu tive um pouco de dificuldade com isso no começo.
Primeiro, tente clicar com o botão direito do mouse no seu iPhone no Banshee e selecione "Import to Library", que teoricamente deveria importar tudo.
Se não, instale o GTK-Pod no Ubuntu Software Center, ele funciona muito bem para extrair música de iPods / iPhones e organizá-los com títulos de arquivo apropriados.
Depois de carregar o iPhone e selecionar todas as músicas que deseja copiar no disco rígido, direcione-o para o local da biblioteca de músicas do Banshee. Isso colocará todas as suas músicas no local desejado e garantirá que as sincronizações futuras não removam suas músicas carregadas no momento.