A maneira mais fácil de contornar este problema é instalar o phpmyadmin e o pacote padrão de dependências Java Development Kit (jdk) dos repositórios padrão do Ubuntu. Abra o terminal e digite:
sudo apt-get install default-jdk phpmyadmin
Isto irá instalar uma versão do phpmyadmin que é tão nova ou mais recente que a versão do phpmyadmin que você está tentando instalar em todas as versões do Ubuntu atualmente suportadas. O default-jdk também é uma versão mais recente que o Oracle Java 6 em todas as versões atualmente suportadas do Ubuntu.