Eu tive o mesmo problema. Parece que isso acontece porque a documentação da Microsoft realiza a instalação de uma versão 17.x de msodbcsql
e as extensões são compatíveis com as versões 11.x ou 13.x ...
Eu resolvi isso forçando a instalação de uma versão 13.X de msodbcsql
.
$ apt-get remove msodbsql
$ apt-get install msodbcsql=13.1.9.2-1
Eu preferiria ter as extensões trabalhando com a última versão do msodbcssql, mas não descobri como, no momento.