Você pode excluir o instalador do Ubuntu do USB formatando-o com discos gnome ou gparted, mas é altamente recomendável salvá-lo caso sua máquina não inicialize, ou se algo não funcionar corretamente, etc. Por exemplo, eu só tinha um USB no momento com o Ubuntu Ubuntu Xubuntu nele. Depois de instalá-lo eu formatei o USB, então instalei um driver Nvidia para minha placa gráfica. Após a reinicialização eu não pude usá-lo e eu estava pensando comigo mesmo: "Cara, eu não deveria ter formatado esse USB!". Se você realmente precisa usar um USB para outra coisa, basta usar outro ou comprar um novo. re realmente barato.