Atualização: # 1
Se você não tem mais o Windows instalado, e unidade D: e E: são unidades externas, conecte essas unidades a outro sistema Windows e execute os dois últimos comandos chkdsk mostrados na responda ou inicie um disco de instalação / reparo do Windows e execute chkdsk a partir dali.
Atualização nº 2:
Vá em frente e use o comando ntfsfix na sua unidade E:, assim ...
sudo ntfsfix /dev/sda3
Se as unidades NTFS são montadas como somente leitura ou não são montadas, provavelmente é porque o Ubuntu acha que seus sistemas de arquivos estão sujos, provavelmente devido à hibernação ou a um sistema de arquivos danificado. Faça isso ...
no Windows ...
- inicializa no Windows
- abra o painel de controle de energia
- escolha
change what the power buttons do - escolha
change options that are unavailable - desmarque
fast startup - feche o painel de controle de energia
- abre uma janela de prompt de comando administrativo
- digite
powercfg /h off - digite
chkdsk /f c: - aprova a execução do chkdsk na próxima reinicialização
- digite
chkdsk /f d: - digite
chkdsk /f e: - reinicialize no Windows para permitir que o chkdsk seja executado na unidade C: