Existe um método de instalar o Ubuntu para rodar "persistentemente" a partir do seu pen drive, mas eu recomendaria contra ele para qualquer uso rotineiro. Unidade flash O flash RAM se desgasta muito mais rapidamente que os SSDs, e o desgaste é muito menos previsível. Você estará correndo alegremente em seu pendrive, e da próxima vez que quiser começar, não vai, porque muitas células ficaram ruins para o sistema de equilíbrio do pen drive funcionar - e não há nenhum aviso sobre isso acontecer.
O seu SSD é mais rápido do que qualquer pen drive (mesmo uma versão topo de linha do USB 3.0 é limitada pela velocidade de transferência do USB, que é menor que a da versão atual da interface SATA). Portanto, a melhor maneira de preservar o início rápido de seu computador é instalar em seu SSD em uma configuração de inicialização dupla ou múltipla. Você gastará vários segundos no GRUB, mas a partir daí, você terá o início mais rápido do seu hardware.