Durante a instalação, você pode ter adicionado o ppa executando este comando:
sudo add-apt-repository ppa:linuxonly/modem+manager+gui
Você pode ter o pacote de desinstalação modem-manager-gui , mas o ppa não é removido.
Então você precisa remover ppa linuxonly/modem+manager+gui
Haverá uma linha na sua pasta /etc/apt/sources.list.d como linuxonly-ubuntu-modem_manager_gui-xenial.list .
Você precisa remover essa linha e fazer isso manualmente executando estes comandos:
cd /etc/apt/sources.list.d
sudo rm linuxonly-ubuntu-modem_manager_gui-xenial.list
OR
sudo add-apt-repository --remove ppa:linuxonly/modem+manager+gui
Depois disso, você pode fazer sudo apt-get update sem nenhum erro.
Para mais informações: Como os PPAs podem ser removidos?