O comando foi bastante incompleto. Para executar ls
de um problema do Ubuntu convidado pelo menos :
VBoxManage guestcontrol "<Name_of_VM>" run --exe "/bin/ls" --username <me> --passwordfile mypassword.txt --wait-stdout
Por isso, você precisa fornecer o caminho completo para o aplicativo. Nós também precisamos de um usuário e um arquivo de senhas que seriam armazenados no diretório do host a partir do qual nós iniciamos o VBoxManage.
Uma abordagem muito mais fácil seria executar um servidor SSH no convidado para ativar o acesso SSH a partir do host.