Eu tenho um problema estranho com o meu editor de texto .
Há alguns dias eu notei que a janela do editor não aparece , quando eu comecei o programa.
Então eu digitei o cli atom . dentro de uma pasta de projeto para abri-lo, e funcionou.
Mas recentemente eu tenho o mesmo problema, portanto não posso usar o editor.
Eu já tentei checar com ps aux|grep atom e me mostra que o Atom está rodando, mas não consigo GUI.
Depois de tudo, tentei matar e reiniciá-lo, mas nada mudou.
Cada resposta será apreciada!
Então, aparentemente, acabei de perceber o que aconteceu com o editor.
Eu não vi nenhuma GUI quando iniciei o programa, mas quando movi meu mouse em uma determinada posição eu vi isso. 
E bem no meio da imagem, há o meu GUI Atom de alguma forma minimizado para 1 × 5 pixel. Depois eu consegui escalá-lo e agora funciona perfeitamente. Estranho, mas por enquanto eu posso usá-lo novamente.
Às vezes tenho o mesmo problema. Ele simplesmente desaparece.
Quando eu faço ALT + TAB não aparece Atom na lista de programas, mas aparece outro, google-chrome pelo exemplo. E escolhendo este Atom para voltar a morar.
Eu não entendo esse estranho, mas trabalhei para mim.
Tchau!
Eu tinha dúvidas de que a janela poderia ser renderizada fora das coordenadas da tela, então usei atalhos de teclado para fazer a janela do Atom ser encaixada no cursor e movê-la.
Para isso, iniciei o Atom e pressionei Alt + F7 . Então a janela apareceu e eu pude posicioná-la com meu mouse.