É devido ao IPv6.
Tente fazer isso: vim /etc/gai.conf
remova o comentário da linha: precedence :: ffff: 0: 0/96 100
Salvar e sair.
Crie o arquivo: sudo nano /etc/apt/apt.conf.d/99force-ipv4
E adicione a linha: Aquire :: ForceIPv4 false;
Espero que ajude!