Às vezes, o Code :: Blocks-13.12 não funciona corretamente no Ubuntu 16.04. Eu também enfrentei um problema semelhante nisso. Talvez haja algum bug que é a causa desse comportamento inesperado de Code :: Blocks-13.12. Eu recomendaria que você instale Code :: Blocks-16.01 em vez disso. É a versão mais recente do Code :: Blocks e é muito melhor que Code :: Blocks-13.12. Primeiro você desinstala / remove Code :: Blocks-13.12 usando o Ubuntu Software. Então você pode instalar o Code :: Blocks-16.01 digitando os seguintes comandos no seu terminal, um a um: -
sudo add-apt-repository ppa:damien-moore/codeblocks-stable
sudo apt update
sudo apt install codeblocks
Um link útil que você pode ver é dado aqui: Como instalar o IDE Code :: Blocos 16.01 no Ubuntu 16,04