Estritamente falando, um disco pode usar MBR ou GPT, mas não ambos. Dito isso, há um hack feio e perigoso , conhecido como MBR híbrido, que é mais usado em Macs, que permite que um disco GPT inclua ponteiros MBR em três de suas partições para o benefício dos sistemas operacionais que não usam GPT. Há muito pouco ou nenhum motivo para usar um MBR híbrido, exceto em Macs com inicialização dupla no Windows 7 ou anterior, ou com outros sistemas operacionais não-GPT / não-EFI. Um MBR híbrido forneceria o benefício NO para o seu caso específico.
Lembre-se de que o modo de inicialização (EFI / UEFI vs. BIOS / CSM / herdado) e o tipo de tabela de partição (GPT vs. MBR) não são necessariamente vinculados. O Windows une os dois, e os sistemas operacionais mais antigos não entendem nem o EFI nem o GPT, mas, além disso, você geralmente é livre para misturar e combinar. Você pode instalar o Ubuntu no modo BIOS em um disco GPT, por exemplo. Dito isso, usar GPT para inicialização no modo EFI e MBR para inicialização no modo BIOS minimizará o risco de problemas, mas geralmente é possível ultrapassar esses limites se isso for necessário. Assim, se você deseja ter uma unidade USB que pode ser inicializada no BIOS ou EFI, você pode, em princípio, usar MBR ou GPT nela. Você precisará instalar os carregadores de inicialização no modo BIOS e no modo EFI, mas a tabela de partições pode ser do tipo. Esse tipo de configuração pode ser difícil de configurar, embora, e de improviso, eu não conheço nenhum site que forneça instruções passo-a-passo para configurá-lo. Existem cerca de um milhão de casos especiais que podem criar problemas para computadores específicos ou para computadores configurados de maneiras específicas (problemas de inicialização segura, firmware com várias opções de tabelas de partição, sistemas 32 versus 64 bits, etc.). Assim, dependendo das suas necessidades, talvez seja melhor planejar a criação de duas ou mais unidades USB inicializáveis. Sim, isso é mais incômodo para carregar e mantê-los em linha reta - mas esse incômodo pode ser menor do que o incômodo envolvido em navegar no campo minado de peculiaridades envolvidas na criação de um meio de inicialização verdadeiramente universal.