Não importa um sistema de arquivos que você escolha no que diz respeito ao compartilhamento. O computador cliente alvo não consegue ver o sistema de arquivos, apenas os arquivos.
Portanto, a escolha do sistema de arquivos está puramente no lado do RAID e do gerenciamento das coisas no próprio NAS.
Para esse fim, recomendo o ZFS. É de longe o mais avançado ayatem RAID disponível (é o sistema RAID utilizado pelos grandes servidores SUN). Sim, é preciso um pouco de aprendizado e compreensão dos conceitos, e pode ser um pouco de fome de recursos (muita memória RAM é boa), mas é um sistema incrível.