Se você instalou o (s) pacote (s) git* dos repositórios padrão, a configuração do Git em todo o sistema deve residir em /etc/gitconfig (pois $(prefix) está vazio para essas instalações do Git). Veja o seguinte trecho git-config(1) manual :
Se não houver tal arquivo, sudo git config --system <name> <value> irá criá-lo para você. Alternativamente, você pode criá-lo manualmente com o seu editor de texto favorito. Esse é o mesmo comportamento dos arquivos de configuração globais ( ~/.gitconfig ) e locais ( $GIT_DIR/config ) do Git