Pode demorar muito tempo - está a encriptar 2 TB de dados "aleatórios" para preparar a unidade. Isso é muito mais seguro do que usar a unidade, especialmente se ela tiver dados de antes.
Eu não posso dar a você uma ideia melhor quanto tempo levará - isso variará bastante com base na potência da CPU, na velocidade do USB e na velocidade da unidade. Eu esperaria executá-lo durante a noite, talvez mais.