Você pode tentar remontar a unidade com o sinalizador de leitura / gravação. Algo como seguir deve funcionar.
Eu verifiquei erros no meu drive externo em USD usando o GParted. Ainda parece que há alguns. Por exemplo, não consigo excluir uma pasta:
sudo rm -rf /media/me/MyDisk/.MyFolder
rm: cannot remove ‘/media/me/MyDisk/.MyFolder’: Input/output error
Você pode tentar remontar a unidade com o sinalizador de leitura / gravação. Algo como seguir deve funcionar.