O comando que você descreve (ecryptfs-setup-private) é para criptografia de diretório inicial. Este é outro tipo de criptografia que apenas criptografa seu diretório pessoal e não é o tipo de disco completo. Então, no seu caso, isso não é o que você tem.
Sua melhor aposta é copiar os dados e reinstalar. No entanto, se você estiver apenas tentando evitar a senha na inicialização, poderá solucionar o problema conforme descrito aqui (certifique-se de ter um backup primeiro, apenas para garantir)
através de uma resposta aqui: