Para uso normal, você nunca deve precisar chamar manualmente a im-config. Alternar entre o IBus e o fcitx é melhor feito usando o Suporte ao Idioma .
De qualquer forma, você fez. Se você tiver certeza razoável de que o problema é causado por sua "bagunça" com configurações de IM, sugiro estas etapas:
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Abra uma janela de console com Ctrl + Alt + F1 e faça o login.
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Execute estes comandos:
rm .xinputrc sudo apt-get purge im-config sudo apt-get install im-config sudo apt-get install xubuntu-desktop sudo reboot
Por favor, note que a remoção da im-config provavelmente resultará na remoção de um monte de outros pacotes. Você precisa aceitar isso. Re-instalar o xubuntu-desktop deve colocar esses pacotes (pelo menos a maioria deles) de volta no lugar.