Embora os detalhes sejam diferentes, eu estava experimentando esse mesmo resultado recentemente com uma placa Intel X710 10GbEx2 no CentOS usando o i40e 1.3.38, conectado via 802.3ad a um Brocade MLXe. O LACP estava funcionando bem, mas os erros persistiriam a cada 30 segundos. Atualizar o driver para uma versão recente (1.3.47) resolveu os erros para mim.
Você pode verificar sua versão do driver com modinfo i40e
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