Bensel:
Foi na minha experiência, ao executar a partir do LiveCD, que você não pode remover o LiveCD por qualquer motivo e esperar que o sistema permaneça ativo. Por que não criar um pendrive USB inicializável para sair e deixar o CD-R para fazer as atualizações? Isso deve funcionar, porque a mídia com o sistema permanece, enquanto você executa as outras operações.