Na verdade, não há resposta específica. A resposta seria relacionada a cada pacote exclusivo. O guia mestre a sua escolha é o que você gosta.
Instalar a partir dos repositórios principais do Ubuntu garante segurança, estabilidade, mas com algumas versões, desde que as políticas do sistema de pacotes do Ubuntu demorem algum tempo.
Portanto, como uma linha de orientação, não adicione repositórios de terceiros, a menos que você realmente precise deles. Portanto, se as versões antigas funcionarem para você, você não deverá adicionar os repositórios de terceiros. Outra grande conseqüência é escolher alguns repositórios de terceiros conhecidos e confiáveis se você precisar deles, então se você não precisa dos repositórios de terceiros, é melhor baixar apenas o .deb se disponível e não adicionar esse repositório