O que finalmente funcionou foi abri-lo no GIMP, por Gepettevs D'Constanzo's sugestão e usando print > print to file
para imprimi-lo como PDF. Portanto, agora não há informações de texto selecionáveis e pesquisáveis. Eu decidi que não precisava da segunda página, então isso funcionou. Ainda frustrado que não há uma maneira mais transparente de achatar um PDF (e frustrado que "achatar" não seja a palavra certa.)
Em outras partes da internet, alguém apontou que o inkscape também é uma boa maneira de editar PDFs. De fato, usar pdftk burst
e Inkscape e, em seguida, pdftk cat
é infinitamente mais eficiente que o PDFedit.