Você pode tentar redefinir a unidade com o comando abaixo
unity --reset
Caso você esteja usando o 14.04, o comando acima é obsoleto e você precisará instalar a ferramenta de ajuste de unidade por
sudo apt-get install unity-tweak-tool
e redefinir o Unity com
unity-tweak-tool --reset-unity
BTW você já tentou sinapse? , muito boa alternativa para o traço de unidade
sudo add-apt-repository ppa:synapse-core/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install synapse
pressione Ctrl + Espaço e pesquise o que quiser