Descobri o que estava errado, /usr/lib/python2.7/lib-dynload/pyexpat.x86_64-linux-gnu.so
estava usando a biblioteca compartilhada /usr/local/lib/libexpat.so.1
quando deveria estar usando /lib/x86_64-linux-gnu/libexpat.so.1
e simplesmente renomear ou remover /usr/local/lib/libexpat.so.1
resolveu os problemas com python.
Uma fonte pode ser encontrada aqui