É possível e a melhor opção é usar um CD ao vivo como Clonezilla Live .
Você também pode inicializar com qualquer Live CD e usar dd para clonar o disco:
dd if=[disk_with_ubuntu] of=[pendrive] bs=512 conv=noerror,sync
Onde [disk_with_ubuntu] é o disco que contém sua instalação do Ubuntu (por exemplo, /dev/sda ) e [pendrive] é seu pendrive. Você tem que ter muito certeza sobre esses parâmetros, caso contrário você pode sobrescrever o disco errado. É por isso que recomendo usar um live CD projetado para essa tarefa precisa.