Crie um link em /var/www da seguinte forma:
sudo ln -s /usr/share/phpmyadmin /var/www/
Nota: desde 14.04 você pode querer usar /var/www/html/ em vez de /var/www/
Se isso não funcionar, você precisa incluir o PHPMyAdmin dentro da configuração do apache.
Abra apache.conf usando seu editor favorito, o meu é vim :)
sudo vim /etc/apache2/apache2.conf
Em seguida, adicione a seguinte linha:
Include /etc/phpmyadmin/apache.conf
Para o Ubuntu 15.04 e 16.04
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sudo ln -s /etc/phpmyadmin/apache.conf /etc/apache2/conf-available/phpmyadmin.conf -
sudo a2enconf phpmyadmin.conf -
sudo service apache2 reload