Você pode usar um programa chamado ARandR . É basicamente o programa perfeito para as suas necessidades.
Descrição:
ARandR is a visual front end for XRandR 1.2/1.3 (per display options), which
provides full control over positioning, saving and loading to/from shell
scripts and easy integration with other applications.
Se ainda não o fez, você pode instalar o ARandR através do Centro de Software ou sudo apt-get install arandr
.