Na sua pasta pessoal ( ~ , geralmente /home/<username> ), a pasta .config tem muitos arquivos de configuração para muitos programas (alguns usam outros "dotfiles ocultos" que começam com um ponto, como .xxxx pastas ou arquivos, também na pasta home) e geralmente as configurações do desktop / gerenciador de exibição também.
Se você quisesse fazer o backup de toda a sua pasta pessoal, isso também seria uma boa ideia e, posteriormente, poderia restaurá-la (copiar / colar) para recuperá-la. Se você alterar user / usernames, o proprietário dos arquivos deverá corresponder ao usuário atual.