A mudança que você notou não é específica do Ubuntu, é devido ao gerenciamento de energia em tempo de execução que está sendo ativado por padrão no kernel do Linux. Para a maioria dos usuários, isso é bom - significa que o poder da GPU pode se adaptar ao uso em tempo de execução, em vez de ser corrigido em qualquer configuração da BIOS. Para reverter para o comportamento anterior, defina o parâmetro do kernel radeon.runpm=0 .
A placa de vídeo não deve exigir configurações manuais para evitar o superaquecimento. Se você achar que sim, então pode ser um problema de hardware (por exemplo, o ventilador precisa de limpeza). Se você acha que o problema é software (funciona bem em outro SO, ou com driver proprietário), então relate um bug na lista de discussão, no canal de IRC ou no bug tracker em Xorg radeon .