Tecnicamente, você pode fazer tudo no shell.
Basta digitar
sudo -i
apt-get update && apt-get -y dist-upgrade && shutdown -P now
sudo -i faz você root até que você efetue logout manualmente usando exit para garantir que seus direitos de sudo não expirem se a atualização demorar muito (geralmente o tempo de direitos de sudo se esgota após 15 minutos se bem me lembro).
O operador && concatena os comandos. Basicamente você pode lê-lo como:
If command 1 finished succesfully execute command 2, if command 2 finished succesfully execute command 3
e assim por diante ... Nota: Os outros comandos só serão executados se o comando tiver terminado com sucesso.
O parâmetro -y após apt-get responde a todas as perguntas solicitadas com 'yes'.
O shutdown -P now desliga o computador para desligamento ( -P ) imediatamente ( now ).
Para obter uma visão geral de quais outros parâmetros existem para shutdown run shutdown --help