Instalar diretamente sobre a versão antiga é a maneira mais estável e mais fácil de atualizar. Você pode usar um programa de backup como o Aptik para fazer backup de seus arquivos de configuração e programas de reposicionados adicionados e usar o gerenciador de arquivos para fazer backup de seus arquivos pessoais em uma unidade externa ou usar um programa de armazenamento em nuvem como o Dropbox.
Basta instalar o antigo Ubuntu durante a instalação com o Live CD, e ele irá sobrescrever a versão antiga. Isso também funciona se você precisar sobrescrever outra distribuição baseada no Ubuntu, como Lubuntu ou Xubuntu.